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6月16日晚，北京市召开疫情防控新闻发布会。会上，北京市政府副秘书长陈蓓通报，经北京市新冠肺炎疫情防控领导小组研究，将北京重大突发公共卫生事件三级应急响应上调为二级。
6月17日上午，北京市举行新型冠状病毒肺炎疫情防控工作第122场新闻发布会。北京市委宣传部副部长、市政府新闻办主任、市政府新闻发言人徐和建，北京市教委新闻发言人李奕出席，两人都戴上了口罩。
此前，在4月30日的北京市第97场新冠肺炎疫情防控工作新闻发布会上，与会发言人们第一次摘下口罩。
6月16日本土病例33例，北京31例，河北1例，浙江1例
6月16日0—24时，31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例44例，其中境外输入病例11例（甘肃10例，四川1例），本土病例33例（北京31例，河北1例，浙江1例）；无新增死亡病例；新增疑似病例3例，均为本土病例（均在北京）。
当日新增治愈出院病例2例，解除医学观察的密切接触者116人，重症病例增加2例。
境外输入现有确诊病例102例（无重症病例），现有疑似病例2例。累计确诊病例1856例，累计治愈出院病例1754例，无死亡病例。
北京昨日新增31例确诊病例、疑似3例、无症状感染者6例
6月16日0时至24时，北京新增报告本地确诊病例31例、疑似病例3例、无症状感染者6例。截至6月16日24时，累计报告本地确诊病例557例，累计出院411例，在院137例，累计死亡9例。尚在观察的无症状感染者12例。
6月16日0时至24时，北京无新增报告境外输入新冠肺炎确诊病例、疑似病例和无症状感染者。截至6月16日24时，累计报告境外输入确诊病例174例，累计出院173例，在院1例。
新增确诊病例中，东城区3例、西城区1例、海淀区3例、丰台区19例、大兴区5例。
全市有11个区无本地报告新增确诊病例，具体为平谷区自有疫情以来无报告病例、延庆区145天、怀柔区131天、顺义区129天、密云区126天、昌平区120天、通州区118天、朝阳区2天、石景山区2天、门头沟区1天、房山区1天。
北京市民非必要不出京，确需离京要持7日内核酸阴性证明
在北京市新型冠状病毒肺炎疫情防控工作第121场新闻发布会上，市政府副秘书长陈蓓表示，二级响应下，要强化的措施包括：非必要不出京，确需离京的要持7日内核酸检测阴性证明。
河北省新增1例确诊，2人隐瞒疫情信息被调查
2020年6月16日0至24时，河北省新增报告新型冠状病毒肺炎确诊病例1例（系雄安新区安新县无症状感染者转确诊）。无新增死亡病例，无新增疑似病例。
6月16日0至24时，河北省报告新增无症状感染者3例，其中：境外输入无症状感染者2例，本地无症状感染者1例（系北京市关联确诊病例的密切接触者）。
另外，据河北安新县公安局通报，6月11日，北京发现疫情后，河北安新籍王某、冯某自北京返回安新县后，不听劝阻，没有申报，拒不配合疫情防控排查工作人员工作，故意隐瞒个人轨迹及与他人接触情况，给疫情防控排查工作带来极大困难。据此情况，安新县公安局立即组织专门力量成立专班，全力开展案前调查工作，并将依据调查情况及实际造成的危害后果，依法追责。6月14日-15日，河北省新增报告确诊病例7例，新增无症状感染者1例。其中，有6例确诊病例和1例无症状感染者均为雄安新区安新县籍人员，确诊的4名儿童最小的仅2岁。
浙江新增一例本土病例，患者长期在北京新发地批发市场经商
6月16日0至24时，浙江新增确诊病例1例。截至6月16日24时，累计报告确诊病例1269例（境外输入病例50例）。
新增确诊病例：吴某某，男，36岁，户籍台州市温岭市，长期于北京新发地批发市场经商。从北京返回温岭后，因发热、头晕、咳痰及胸闷等症状前往温岭市第一人民医院发热门诊就诊，并主动上报当地卫生院。温岭市第一人民医院和当地卫生院接报后立即向温岭市疾控中心报告，温岭市第一人民医院予以收治入院实行隔离医学观察。6月16日核酸检测结果为新冠病毒阳性。结合患者流行病学史、临床表现和实验室检测结果，经专家会诊后，确诊为新型冠状病毒肺炎病例。
目前，已排查出当地密切接触者11人，全部实行集中隔离医学观察，核酸检测均为阴性。
北京抽调100名医务支援地坛医院
北京市医管中心已抽调100名医务人员前往地坛医院，支援那里的新冠肺炎集中救治工作。100名医务人员包括24名医生、62名护士、8名检验人员、6名放射人员，来自19家北京市属医院。11日至15日，北京106例确诊全部在地坛医院集中救治。
铁路部门公布进出北京地区列车免费退票措施
为配合北京市做好应急响应级别由三级提升到二级的疫情防控工作，铁路部门决定：自2020年6月17日0时起，旅客在车站、12306网站等各渠道，办理2020年6月16日24时前已购的进出北京地区各次列车有效车票退票时，均不收取退票手续费，购买铁路乘意险的一同办理。
北京对所有小区全面实行严格封闭式管理
昨天上午，北京市委常委会召开会议， 会议要求： 对所有与新发地批发市场有密切接触和关联的人员进行全面排查、核酸检测和居家观察，对所有农贸市场、餐饮店、食堂等重点场所进行全面防疫检查、环境消杀和核酸检测，对所有小区全面实行严格封闭式管理，对重点区域和重点人群全面进行核酸检测并扩大检测范围，全面提高各类医疗卫生机构、学校、养老机构、地铁公交等防控等级，全面落实重点人员禁止离京的措施，坚决遏制疫情在市内扩散、向市外扩散。