链霉菌(Streptomyces),隶属链霉菌目(Streptomycetales),链霉菌亚目(Streptomycineae),链霉菌科(Streptomycetaceae),为土壤微生物群的重要组成部分,广泛存在于湖泊、海洋和海洋等环境中。链霉菌属是放线菌门中最大的一个属,截止至2023年2月,链霉菌科在原核生物标准命名名录(List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature, LPSN)中收录的有效发表并正确命名的物种数为732个[3]。
一、概述
链霉菌自1916年由Waksman和Henrici从土壤中发现后,于1943年提出建立链霉菌科[1]。随着分子生物学工具的发展,Stackebrandt等[2]在1997年通过16S rRNA相似性及DNA-DNA杂交的结果构建了链霉菌的系统发育树,这标志着链霉菌分子分类时期的开始,并建议将链霉菌科提升为放线菌纲中的一个亚目,命名为链霉菌亚目。2012年发布的《伯杰氏系统细菌学手册》(Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology)中Kämpfer等将链霉菌亚目正式划分为链霉菌目[3]。
链霉菌具有特征性的形态特点,其为革兰氏阳性需氧菌,可产生各种水溶性或脂溶性色素,有发育良好的分枝菌丝,菌丝纤细,横隔稀疏,分化为营养菌丝(又称基内菌丝)、气生菌丝。气生菌丝成熟后发育为孢子丝,孢子丝可呈直立、螺旋状、轮生等多种形态,可裂生大量分生孢子进行播撒(图1)。
1940–1970年之间的近30年被称为「抗生素发现的黄金时代」,在此期间研究人员从土壤链霉菌中发现了大量沿用至今的抗生素,如链霉素、红霉素、四环素、卡那霉素、土霉素等[4]。有趣的是,大约三分之二的天然抗生素是由放线菌产生,其中约75%的抗生素由链霉菌属产生,链霉菌为人类医疗做出了巨大的贡献。链霉菌目前主要运用于抗生素、抗肿瘤制剂和免疫抑制剂的生产研究中[5],作为最具代表性的放线菌之一,是研究人员长期关注的重要功能类群。
图1 链霉菌形态结构的模式
二、灰色链霉菌的培养特点
链霉菌属的主要代表是能产生链霉素的灰色链霉菌,其在标本中呈现革兰氏阳性的细长,不规则分枝的丝状体(图2)。
图2 链霉菌在标本中的形态
灰色链霉菌生长缓慢,在血平板37℃可缓慢生长。培养初期菌落干燥不透明,表面粗糙,边缘不整齐,菌落陷入琼脂内,不易挑起,形成「噬琼脂」现象。随着时间的延长,菌落变大,中心凸起,逐渐形成菊花状或放射状,并产生色素和溶血环,有剧烈的土腥味。
灰色链霉菌菌落不易散开,革兰染色可见革兰阳性杆菌,有细长的不规则分枝状菌丝。该菌抗酸染色和弱抗酸染色结果为阴性(图3)。
图3 灰色链霉菌培养特性
注:A:血平板,37℃,3d,菌落呈黄色、菊花状、放射状,轻微「噬琼脂」;B:血平板,37℃,5d,菌落产生色素C:血平板,37℃,7d,菌落开始出现透明溶血;D:血平板,37℃,7d,可见明显透明溶血环;E:血平板,37℃,5天,菌落为黄色;F:菌落革兰染色(100×);G:弱抗酸染色(100×);H:抗酸染色(100×)。
三、链霉菌与诺卡菌的鉴别
相较与链霉菌属,诺卡菌的生长同样缓慢,在血平板室温或37℃可缓慢生长,45℃时亦可生长。菌落大小不等,致密干燥,凸起,表面有皱褶,颗粒状,不溶血,而链霉菌明显溶血。菌落陷入琼脂内,呈现「噬琼脂」现象。不同种类可产生不同色素,,但大部分主要以白色菌落为主,如北京诺卡菌菌落呈白色(图4A),皮疽诺卡菌菌落为黄色,需与链霉菌相鉴别(图4B、C)。诺卡菌镜下为革兰阳性杆菌,有细长的分枝菌丝,亦或同时有杆状或球状存在,丝状体呈粗细不等的串珠状。菌体着色不均,有颗粒感,弱抗酸染色阳性(链霉菌弱抗酸染色阴性),抗酸染色阴性(图4D-F)。链霉菌还需与冢村菌属、红球菌属、戈登菌属和嗜皮菌属作鉴别(表1)。
图4 诺卡菌培养特性
注:A:北京诺卡菌,37℃,7天,白色菌落;B:皮疽诺卡菌,37℃,7天 ,黄色菌落;C:灰色链霉菌,黄色菌落;D:革兰染色阳性,染色不均一性明显,呈颗粒状(100×);E:抗酸染色阴性,菌体可见颗粒(100×);F:弱抗酸染色,阳性(100×)。
表1 链霉菌属与其他菌属鉴别要点
注:+,90%以上菌株阳性;-,90%以上菌株阴性;V,11%-18%菌株阳性;ND,无资料
四、链霉菌与其它菌属的鉴别
Lechevalier在1976年提出以化学分类研究与形态特征相结合用于区分链霉菌属,可作为链霉菌定属的标准[6]。根据酪氨酸、黄嘌呤、次黄嘌呤、脲酶、乳糖、木糖、硝酸盐等生化反应特点,可大致对链霉菌属进行区分(表2)。
表2 链霉菌属内鉴别要点[7]
注:+,90%以上菌株阳性;-,90%以上菌株阴性;V,11%-18%菌株阳性;ND,无资料
五、临床意义
链霉菌为土壤中常见的腐生菌[8],可从呼吸道标本、耳道分泌物和创面分泌物分离出,但只有少数病例报道与感染相关。链霉菌可引起足菌肿,为一种慢性肉芽肿性皮下炎症性疾病,最常见的致病菌为索马里链霉菌,感染最常累及足部,可侵犯手和身体其他部位,临床表现为足部皮肤破裂和窦道形成、慢性化脓性生长及具有肿瘤样结节形成 [9]。在已报道的病例中,常见于机体免疫功能低下患者,如瓣膜置换术后[10]、晚期恶性肿瘤[11]、艾滋病[12]、克罗恩病[13]或其他需要免疫抑制剂治疗的严重疾病,链霉菌可导致皮肤脓肿、发热、关节炎、肺炎、菌血症和脓毒血症等。但近年来也有报道免疫功能正常的患者肺部感染链霉菌的案例[14],由此可见,链霉菌为一种潜在的病原体。
因此,对于临床分离的链霉菌,如何排除污染,确认其为致病菌,仍需要微生物工作者加以判断。对于临床有感染症状的患者,有菌部位标本分离出的链霉菌,我们需查看原始标本接种的平板是否为纯培养的链霉菌,原始标本涂片结果是否可见分枝状菌丝(革兰、抗酸和弱抗酸染色),然后结合形态学特点,综合考虑其是否为致病菌。若确定为致病菌,可借助形态学鉴定、质谱鉴定[15]和分子手段(16S rDNA测序、宏基因组测序等)等方法,助力链霉菌的准确鉴定。
六、链霉菌感染的治疗
对于链霉菌感染的治疗,目前尚无统一的治疗标准和路径,而且链霉菌的体外药敏尚无参考折点,治疗通常是参考诺卡菌感染相关的数据。McNeil MM[16]对37株灰色链霉菌进行体外药敏试验,结果显示最有效的药物是多西环素、红霉素、亚胺培南、米诺环素和氨基糖苷类药物,而对复方磺胺甲恶唑(TMP-SMX)、氨苄西林、头孢噻肟和环丙沙星的耐药率较高。笔者参照CLSI M45 A3少见菌药敏推荐中诺卡菌及其它需氧放线菌进行体外药敏试验,显示阿米卡星、头孢曲松、克拉霉素、亚胺培南、利奈唑胺、米诺环素、妥布霉素敏感,复方新诺明和环丙沙星耐药,结果与McNeil MM等学者的研究结果基本一致[16]。Nasher[17]对10株索马里链霉菌的体外药敏结果研究表明利福平、红霉素、妥布霉素、夫西地酸和硫酸链霉素为敏感率较高的抗菌药物,而甲氧苄氨嘧啶出现高耐药率。由此可见,部分链霉菌会表现出复方磺胺甲恶唑(TMP-SMX)和甲氧苄氨嘧啶的高耐药率,对于临床上分离到的链霉菌,若治疗统一参考诺卡菌的话,可能到导致抗感染治疗的失败,因为TMP-SMX常用来治疗诺卡菌的感染。
链霉菌生长缓慢,抗感染需要足够的疗程。2015年报告首例灰色链霉菌引起的颈面部足菌肿,患者经静脉注射青霉素8周后,病变消退[18]。24岁的男性库欣综合征患者,胸腔积液培养为链霉菌,患者使用广谱抗生素后抗感染效果欠佳,随后改用克拉霉素6个月好转[19]。2007年一例免疫功能正常的52岁妇女,由链霉菌引起的左下叶肺炎,经多西环素治疗6个月后感染完全消失[14]。因此,对于链霉菌引起的感染,抗感染需要足够的疗程,而且在条件允许的情况下,尽可能开展体外药敏试验,从而为临床提供诊疗依据。
七、小结
链霉菌为环境中常见的腐生菌,在培养基上菌落呈现菊花状或放射状,并产生色素和溶血环,有剧烈的土腥味,形成「噬琼脂」现象。链霉菌不易引起人类致病,但对于免疫功能低下和免疫缺陷患者,需警惕其引起的侵袭性感染。对于临床中到的链霉菌是否为感染,还需结合标本来源(是否为无菌部位)、原始标本涂片结果、原始标本接种后平板生长情况和患者的临床表现综合判断。再者,临床上部分链霉菌会表现出复方磺胺甲恶唑(TMP-SMX)和甲氧苄氨嘧啶的高耐药率,不推荐TMP-SMX作为治疗链霉菌的首选药物。
参考文献
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作者简介
陈敏
广东省江门市新会区中医院检验科 主管技师。从事临床微生物检验工作十年,目前在广东省人民医院检验科进修。
林淳
广东省广州市荔湾区人民医院检验科 主管检验技师。从事临床检验工作13年,PCR组组长,现主要负责实验室质量管理,目前在广东省人民医院检验科微生物组进修。
袁凯旋
广东省人民医院检验科临床微生物组 主管技师;华南真菌感染精准诊疗与经济学研究联盟秘书;广东省药学会第一届临床微生物专家委员会委员;广东省人民医院检验科进修生管理员、微生物组教学管理员。从事临床微生物检验多年,较擅长真菌感染的实验室诊断及分子鉴定,以第一作者/通讯作者发表国内外论文多篇,带教进修生和实习生论文多篇。主要研究方向:临床病原真菌研究。
作者:陈敏1,2,林淳1,3;指导:袁凯旋1;单位:1广东省人民医院检验科;1江门市新会区中医院检验科 ;3广州市荔湾区人民医院检验科;审校:王占伟(北京大学人民医院)
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原链接戳:【慧眼识菌】浅谈“链霉菌”
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