1、数据库开发背景

为了让临床医生或科研工作者能够更全面、更便捷地获取肺炎研究的最新进展，中日医院曹彬教授团队借助最新的ChatGPT-4模型检索PubMed中发表的肺炎研究文献，并根据文献的研究类型和研发方法对文献进行了分类，同时总结了文献中的关键信息。

2、数据库介绍

本数据库使用Pubmed API对Pubmed数据库进行检索，针对常见的肺炎病原体的相关研究进行了检索（见表1）。对于获取的文献，通过ChatGPT-4模型的API对每篇文献进行逐篇分析。模型首先依据文献的研究类型将文献分类为基础研究和临床研究。对于基础研究文献，进一步根据其研究内容将文献分类为：病原微生物研究、宿主-病原互作研究、免疫反应研究、炎症机制研究、组织病理学研究、分子病理学研究、宿主遗传易感性研究、病原体遗传变异研究、疫苗研究、抗菌药物研究。根据研究所用的材料将文献分类为：细胞试验、动物实验、组学。对于临床研究，根据研究内容将文献分类为：流行病学、病原检测技术研究、影像学研究、辅助检查研究、病情严重程度评估、肺炎相关并发症研究、特殊人群肺炎研究、肺炎治疗方法研究、预后研究。根据研究方法将文献分类为：横断面研究、前瞻性队列研究、回顾性队列研究、病例对照研究、随机对照试验、非随机对照试验、系统评价、Meta分析、临床指南或共识、病例报道。对于每篇文献的内容进行分析，并提取出研究的关键信息：研究问题、研究假设、研究设计、研究样本、研究结果、研究结论、研究创新点、研究局限性、改进方向。

使用者可以在数据库中搜索感兴趣的肺炎病原体和特定的研究问题。对于检索出的文献，可以根据发表时间、研究内容、研究方法进行筛选，从而获得肺炎病原体在某一具体研究问题中的最新进展。每篇文献的关键信息可以帮助使用者了解文献的研究概况，快速掌握研究进展。

表1. 常见肺炎病原体列表

3、使用说明

如图3-1所示，在“中国肺炎研究”官方网站首页（https://www.chinapneumonia.cn/）上方选择“肺炎相关文献检索”进入肺炎文献检索页面。

图 3-1 肺炎研究文献数据库入口

如图3-2所示，进入检索页面后，在中部的搜索栏中输入目标病原体或研究问题的名称，支持中文或英文名称，且搜索栏支持联想功能。

图 3-2 肺炎研究文献数据库检索页面

图3-3显示搜索后的结果页面。左侧显示了筛选栏，可对文献的发表年份、研究方法类型、研究内容类型、病原体进行筛选。右侧显示了检索出的文献的标题、摘要、期刊、期刊影响因子、研究内容和研究方法类型。

图3-3 肺炎研究文献数据库搜索结果示例

图3-4显示了一篇具体文献的详细页面。可通过右侧的索引栏快速定位到这篇文献的相应信息，包括文献的研究问题、研究假设、研究设计、研究样本、研究结果、研究结论、研究创新点、研究局限性、改进方向。

图3-4 肺炎研究文献数据库文献总结页面示例

4、未来开发方向

本数据库目前处于试运行状态，暂只收录了2024年发表的影响因子大于等于5分的期刊中的常见病原体相关肺炎文献。后续我们将逐渐扩展时间范围至2010年，并扩展其他肺炎相关致病微生物的相关文献。由于ChatGPT的成本原因，本数据库暂未加入全文。如成本允许，将加入全文数据。曹彬教授课题组每年总结肺炎相关研究进展，并发布综述文章。后续我们将尝试基于本数据库收录的文献开发自动文献综述功能，进而实现每月发布肺炎相关研究综述文章。我们将继续完善数据库的构建流程，并将此流程开发成面向大众的应用程序，使其他专业的研究者可以使用此程序总结感兴趣领域的文献。后续我们将引入Meta分析流程，实现自动Meta分析功能。

作者介绍

刘正平

中日友好医院呼吸与危重症医学科医师，毕业于清华大学医学实验班，主要从事于深度学习技术在呼吸道感染方面的应用。

曹彬

主任医师/教授，博士生导师；中日友好医院副院长，呼吸与危重症医学科主任，国家呼吸医学中心副主任，中国医学科学院呼吸病学研究院副院长。教育部长江学者特聘教授、国家杰出青年科学基金获得者、国家科技创新领军人才、首届新基石研究员。现任中华医学会呼吸病学分会候任主任委员、中国医学科学院学术咨询委员会学部委员、中国抗癌协会第一届肿瘤呼吸病学专业委员会主任委员、国际流感和呼吸道病毒感染学会(ISIRV)抗病毒小组(AVG)委员、Clinical Respiratory Journal副主编、CMJ-PCCM副主编。

* 文章仅供医疗卫生相关从业者阅读参考

本文完

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