疫情新观察1丨奥密克戎BA.4和BA.5突变株在南非迅速扩散,新变异半年出现一次?美发现感染空气传播的病毒颗粒概率约1/100?
来源: 生命科学前沿、每日经济新闻、华山感染等 2022-05-10

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随着新冠病毒的不断变异,疫情形势走向变幻莫测,全球多地本土疫情呈点状暴发。当下,国内北京、上海等多个城市均处于疫情胶着状态,对国民生产、生活造成巨大影响。人们热切关注疫情将如何走势?应对策略该如何调整?新冠治疗又有哪些新的突破等热点问题?越来越多国内外权威专业人士发表研究成果、观点分析、救治经验。为此《呼吸界》从今天开始推出「疫情新观察」专栏,把及时追踪并精选的国内外最新、最前沿、最权威的信息和报道分享给大家。也期待专家们的投稿和参与。



内容提要

  • Cell Host & Microbe研究发布:奥密克戎株疫情仍可导致高龄人群或免疫缺陷人群重症率的增加,进一步提高全程疫苗接种及加强接种比例十分重要
  • 两针灭活疫苗接种后的受试者对奥密克戎株的抗体滴度水平较原始株下降至少5.3倍
  • Omicron BA.4和BA.5的突变株在南非迅速扩散,更容易发生免疫逃逸?新的变异似乎大约每六个月出现一次?
  • 美研究发现接触受污染表面感染新冠病毒的几率为1/100000、而感染空气传播的新冠病毒颗粒的概率约为1/100?
  • 吴尊友:物传人不是新冠主要传播途径


Omicron BA.4和BA.5的突变株在南非迅速扩散,更容易发生免疫逃逸?新的变异似乎大约每六个月出现一次?


距离南非第一次发现Omicron变异株六个月之后,南非又迎来了新的一轮病情爆发,两种分别被命名为BA.4和BA.5的突变株在南非迅速扩散。



作为两株由BA.2衍生出来的突变株,BA.4和BA.5在BA.2的基础上出现了新的突变位点。早期在南非BA.4和BA.5的病例数目增长速度大概维持在每天1200例,而现在平均每天出现近5000名病例,证明这两种亚型的突变株相比之前流行的BA.2可能有着更强的传播能力。


免疫逃逸造成传播能力的增强


那么新的BA.4和BA.5变异株为什么有这么强的传播能力呢?华盛顿州西雅图Fred Hutch研究中心的病毒进化生物学家认为,针对BA.4和BA.5具有更强的传播能力可能有两种解释:


一种可能性是, 它们天生就更擅长传播,病毒自然进化帮助更容易感染人群,适者生存,这是生物界的固有法则。


另一种解释是, 新的突变株更容易发生免疫逃逸,过去通过接种疫苗产生的抗体或者感染其他突变株产生的抗体无法有效的中和这两种亚型,从而使它们能够感染已有免疫力的人,造成大规模的感染。


随着进一步的研究表明,BA.4和BA.5亚型的增长,至少部分是因为它们逃避免疫反应的能力。南非德班非洲卫生研究所(african Health Research Institute)的研究队分析了39名在第一波Omicron流行中被感染的人的血液样本,其中15人接种了疫苗。体外实验发现, 这些样本中的抗体对BA.4或BA.5中和效果相比对Omicron毒株中和效果要低好几倍


北京大学病毒学家谢晓亮领导研究团队近日在ResearchSquare预印本服务器发表相关文章。他们的研究发现由BA.1亚型感染引发的抗体对BA.4和BA.5的保护效果较弱。这些研究充分表明 BA.4和BA.5两种突变株具备一定的免疫逃逸能力



另外通过对BA.4和BA.5两种突变株的刺突蛋白分析发现,两种亚型的刺突蛋白上都携带一个F486V的关键突变,有研究团队此前发现,对于负责感染细胞和激发免疫反应的主要目标的病毒刺突蛋白来说,这一突变可以帮助变异株逃逸许多病毒中和抗体,从另一个角度证明了BA.4和BA.5具有较强的免疫逃逸能力,这可能是这两种亚型的毒株在南非造成大规模感染事件的原因之一。



可预见的突变株感染浪潮


虽然BA.4和BA.5已在几个欧洲国家和北美发现,但这两个变种可能不会在这些地方引发新的COVID-19感染大潮——至少不会马上。BA.4和BA.5是由BA.2亚型衍生出来的新的突变株,而BA.2刚刚席卷欧洲,人群的免疫力可能仍然很高。在北美一些出现了BA.4和BA.5变异株的地方,也出现了其他Omicron亚变异体。其中一种名为BA.2.12.1的变种,也有能力躲避此前Omicron病毒感染和疫苗接种引发的抗体。



如果SARS-CoV-2继续保持这种突变趋势,那么新冠病毒的演变可能会与其他呼吸道感染病毒相似,如流感病毒。在未来可能会看到,在人群中循环的突变体(如Omicron)所具有的免疫逃逸突变与整个人群的免疫力下降相结合,成为周期性感染浪潮的关键驱动因素。


新冠病毒之前的一些变异株,包括Alpha、Delta和Omicron,与原始毒株相比有了很大的不同,这些变异株都是从SARS-CoV-2家族树的遥远分支中出现的。一些研究人员认为,我们时刻警惕变异毒株对于人群的威胁。


尽管现在Omicron以及其亚型在全世界流行毒株种占绝大部分,但是一些过去造成过大流行的变异株如delta株也并没有完全消失,随着全球对Omicron及其亚型的免疫力增强,新的delta株可能会卷土重来。无论它们的来源是什么,新的变异似乎大约每六个月出现一次,这可能是一种解读COVID-19流行将适应的结构目前观察到的模式的方法。


来源:生命科学前沿(ID:advancedlifesci);作者:复旦大学 mzz;责编:中科院 Karwai



美研究发现接触受污染表面感染新冠病毒的几率为1/100000、而感染空气传播的新冠病毒颗粒的概率约为1/100?吴尊友:物传人不是新冠主要传播途径


据科技日报5月10日报道,美国科学家在近日出版的《暴露科学与环境流行病学杂志》上撰文指出,他们对从校园周围的空气和表面采集的样本进行测试后发现,人们从呼吸的空气中感染新冠病毒的可能性是从接触表面感染的1000倍。


在2020年8月至2021年4月期间,密歇根大学环境健康科学和全球公共卫生教授理查德·奈泽尔及其同事在封闭的校园内的不同地点使用气泵和拭子采集样本。他们总共收集了250多个空气样本,其中1.6%的样本新冠病毒检测结果呈阳性。而在500多个表面样本中,1.4%呈阳性。


结果表明,最危险的环境是健身房,在健身房采集的样本中,75%的空气样本和50%的表面样本结果显示阳性,其中最容易受到污染的是饮水机按钮,而从健身器材中提取的样本均未呈阳性。另外,从办公室或电脑键盘、电灯开关、桌面、微波炉、冰箱把手或学生桌采集样本结果为阳性的几率要低很多。


随后,研究人员将阳性样本与校园内实际的新冠病例进行比较,结果发现,感染空气传播的新冠病毒颗粒的概率约为1/100;而接触受污染表面感染新冠病毒的几率为1/100000,前者为后者的1000倍。


此前,在国务院联防联控机制召开新闻发布会上,中国疾控中心流行病学首席专家吴尊友表示,过去两年多的新冠防控中发现,新冠病毒可能通过「物传人」的方式进行传播,但不是疫情的主要传播方式。通过洗手可以简单有效地切断这一途径。保持手的清洁卫生可以有效降低新冠病毒感染的风险。


来源:每日经济新闻、科技日报、中新视频



Cell Host & Microbe研究发布:奥密克戎株疫情仍可导致高龄人群或免疫缺陷人群重症率的增加,进一步提高全程疫苗接种及加强接种比例十分重要



前言: 近期国家传染病医学中心、上海市传染病与生物安全应急响应重点实验室、华山感染张文宏教授团队和复旦大学生命科学学院王鹏飞教授团队共同合作评估了奥密克戎变异株四个亚型对两剂灭活疫苗和第三针加强接种后的免疫逃逸特征,相关成果于5月8日发表于 Cell Host and Microbe杂志(2021 IF 21.023)。


截至2022年5月,全球已报道逾5亿1千万人次的新型冠状病毒肺炎病例。SARS-CoV-2的奥密克戎变异株最早于2020年11月检出,目前已在全世界大范围流行,出现多个子谱系,分别命名为:BA.1,BA.1.1,BA.2,BA.3,BA.4,BA.5等,另外重组亚型XD,XE,XF毒株近期也被检出。近1-2个月以来,BA.2亚型的比例迅速上升,成为近期多地疫情的主要流行株。流行病学的研究显示,BA.2目前已经在40多个国家和地区检出,其传播能力较BA.1高约30%,感染后病毒载量比BA.1高2倍;其子亚型BA.2.12.1 含有L452Q突变,在美国检出较多,具有传播优势。


奥密克戎各亚型对现有疫苗引发或单克隆抗体介导的中和能力的敏感性



研究发现,两针灭活疫苗接种后的受试者对奥密克戎株的抗体滴度水平较原始株下降至少5.3倍。四个亚型的假病毒实验评价显示,针对BA.2的中和抗体滴度与BA.1相似或低于BA.1。在第三针同源(灭活疫苗)或异源接种后,抗体滴度显著升高,抗体阳性率达到至少75%。最近,已经报道了三种重组谱系(XD,XE和XF),但预计其抗体逃逸与研究的4个奥密克戎亚系没有显著差异,因为它们的S蛋白与BA.1或BA.2相同。



奥密克戎BA.1株的中和能力既往探索


其实在21年12月,华山感染张文宏教授团队和王鹏飞教授团队均在两针灭活疫苗和三针同源/异源接种的血清样本中评估奥密克戎BA.1株的中和能力,研究发现两针灭活疫苗针对奥密克戎变异株的抗体滴度下降较为明显,中和抗体滴度下降至6.04,较原始株降低了约10倍。无论是何种类型第三针加强后(灭活疫苗或重组亚单位蛋白苗),血清标本对奥密克戎株的中和抗体滴度阳性率均达到了100%。




本项研究的科学意义:此次研究进一步证实,对于适宜接种的人群,推广疫苗加强针注射仍然是预防SARS-CoV-2传播,特别是应对奥密克戎株传播的有效手段之一。奥密克戎株疫情虽然较原始株及Delta株的病死率及重症率有所下降,但仍可导致高龄人群或免疫缺陷人群重症率的增加,因此,对于适宜接种的人群,进一步提高全程疫苗接种及加强接种比例十分重要。





参考文献 


1. https://outbreak.info/

2. Ai, Jingwen et al. Antibody Evasion of SARS-CoV-2 Omicron BA.1, BA.1.1, BA.2 and BA.3 Sub-lineages. Cell Host & Microbe,DOI: https://doi.org/10.1016/j.chom.2022.05.001

3. Ai Jingwen,Zhang Haocheng,Zhang Yi et al. Omicron variant showed lower neutralizing sensitivity than other SARS-CoV-2 variants to immune sera elicited by vaccines after boost.[J] .Emerg Microbes Infect, 2022, 11: 337-343.

4. Wang Xun,Zhao Xiaoyu,Song Jieyu et al. Homologous or heterologous booster of inactivated vaccine reduces SARS-CoV-2 Omicron variant escape from neutralizing antibodies.[J] .Emerg Microbes Infect, 2022, 11: 477-481.



来源:华山感染(ID:hsinfect);图文编辑:张怡,艾静文;审校:艾静文





本文完
责编:Jerry



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